因果之花绽放后的宇宙重归平静，但这份安宁仅仅持续了三百年。当银河联邦将观测站延伸至新诞生的小宇宙边缘时，一种诡异的“暗熵波动”开始干扰所有量子通讯设备。最初，这些波动只表现为随机的信号杂音，可随着时间推移，星图上开始出现诡异的黑色斑块，那些区域内的恒星正在以违背物理法则的速度坍缩成黑洞。
“这不是自然现象。”琳恩的声音在紧急会议上显得格外凝重。她调出全息投影，星图上的黑色斑块正在以斐波那契数列的规律蔓延，“暗熵波动的频率与因果之茧孵化前的混沌能量存在某种共振。”洛岚则发现记忆棱镜表面再次浮现纹路，这次的图案像是无数纠缠的蛇，不断吞噬着彼此的尾巴。
就在联邦科学家们焦头烂额之际，启源星的守护者纪念馆突然出现了异常。地面裂开蛛网状的缝隙，从中渗出半透明的流体，这些流体在空气中凝结成文字：“虚数裂隙已开，观测者的代价显现。”混沌观测者的声音再次响起，但这次带着明显的痛苦：“因果之茧的绽放撕开了现实与虚数的边界，我们必须阻止‘熵噬者’的降临。”
神秘的熵噬者被证实是来自虚数维度的古老存在，它们以宇宙中的熵增为食。因果之茧创造新宇宙的过程，产生了超乎想象的熵流，如同在虚数之海上点燃了灯塔，吸引来了这些恐怖的存在。熵噬者形态诡谲，没有实体，更像是一团不断变化的阴影，所过之处，物质的原子结构都会被强行拆解，转化为纯粹的能量。
联邦迅速组建了新的特别行动组，除了洛岚、琳恩等老成员，还加入了来自新生小宇宙的特殊人才——弦律操控者艾琉。她能通过拨动宇宙弦产生特殊频率，干扰熵噬者的行动。当行动组驾驶经过全面改造的“永恒号”星舰接近暗熵波动源时，他们遭遇了前所未有的危机。
星舰的护盾在接触暗熵的瞬间就开始疯狂过载，舰体表面出现了奇怪的结晶，这些结晶以肉眼可见的速度生长，仿佛要将整艘星舰变成一座巨大的冰雕。琳恩发现这些结晶的分子结构与混沌观测者的星尘极为相似，这暗示着暗熵与混沌观测者之间存在着某种隐秘联系。
“我们需要找到虚数裂隙的坐标！”洛岚大声喊道。关键时刻，影月的熵能感知发挥了作用，她的瞳孔中浮现出暗紫色的纹路，指向星图上一个看似普通的星云。当星舰靠近星云时，现实开始扭曲，空间如同被无形的手揉皱的纸张，出现了无数细小的裂痕。