时枢座在星河中流转百年后，宇宙间突然弥漫起一层半透明的幽蓝雾气。这层雾气所过之处，生命体的灵能场出现异常共鸣，机械装置则陷入自我意识觉醒的混乱状态。银河联邦的灵能监测网显示，世界之根的根系开始分泌出珍珠色的黏液，在虚空中勾勒出古老而神秘的图腾，这些图腾与各个文明古籍中记载的“灵墟之门”图案完全吻合。
“这不是自然现象。”琳恩的声音在颤抖，全息屏幕上跳动的波形图呈现出混沌却有序的分形结构，“根据灵能共振检测，这些雾气携带着某种来自高维的意识频率，正在侵蚀所有物质与能量的本质。”洛岚的记忆棱镜表面浮现出类似蜂巢的纹路，当他将手放在棱镜上时，一段破碎的画面涌入脑海：在某个超越认知的维度空间中，无数半透明的生物如同水母般漂浮，它们触须所及之处，星球的灵能核心被悄然替换。
此时，启源星的守护者纪念碑突然发出刺耳的嗡鸣，地面裂开蛛网状的缝隙，从中走出一位由灵能粒子凝聚而成的存在。“我是灵墟的守望者。”它的声音如同无数古老灵魂的低语，“灵墟之门即将开启，维度寄生体正试图将整个宇宙转化为它们的温床。当寄生体完成同化，所有文明的灵能都将成为它们操控的傀儡。”它挥手间，空中浮现出令人绝望的景象：星系被幽蓝雾气包裹，逐渐失去光芒，沦为寂静的死域。
银河联邦紧急组建了跨维度作战小队，队伍中加入了一位特殊成员——来自灵能之海的共鸣者薇尔。她能够感知灵能的细微波动，并将其转化为实体攻击，但过度使用能力会导致灵能反噬，逐渐失去自我意识。当“灵墟号”星舰驶入雾气弥漫的星域，诡异的现象接踵而至：舰体的金属开始呼吸般起伏，控制台上的按钮自发排列成陌生的符文，船员们的影子在墙壁上扭曲成不属于自己的形态。
“这些雾气在改写物质的灵能编码！”影月的熵能感知发出尖锐警报，她的瞳孔中紫色光芒剧烈闪烁，“寄生体正在将现实解构为可吸收的灵能碎片。”洛岚尝试用记忆棱镜驱散雾气，却发现棱镜上的蜂巢纹路开始吞噬自身光芒，反而增强了雾气的侵蚀力。
灵墟的守望者突然现身星舰，它的身体变得透明，仿佛即将消散：“要阻止寄生体，必须找到灵墟之门的核心——那里沉睡着‘灵墟之核’，它既是寄生体的宿主，也是平衡灵能的关键。但核心区域的灵能风暴足以撕碎任何实体。”它的手掌摊开，投影出一群形似脉络的黑色生物，它们正沿着世界之根的图腾蔓延，所到之处，灵能结晶成尖锐的骨刺。